Yo si tuvieses tres discos duros, sólamente particionaría el disco 1, con una aproximadamente de 20 Gb, par instalar el windows y sus programas. El resto lo dejaría como está.

sobre hacer un particion de 20 megas para el sistema operativo hay que puntuallllizar algunas cosas, porque ese tamaño depende del uso que se le de.
Es un tamaña apropiado (yo la tengo de 18 megas) si no eres de los que estas instalando y desinstalando programas, estas operaciones requieren espacio adicional para trabajar, archivo de paginacion, MFT, etc...
Tambien hay que ver que parte de esa particion utilizas para determinar el tamaño, se dice que el tamaño minimo debe ser de 10 megas y dejar libre al menos 5 megas.
Yo tengo una particion de 18 megas, de la que esta ocupada 5.5 megas, y no soy de los que instalo nuevos programas, tengo los programas que utilizo y no los cambio, cualquier otro programa lo instalo en otra particion, el disco c: permanece practicamente inalterable durante años.