Solo por probar barna....porque no pones el disco que te da el error y arrancas desde el Cd de Windows que tengas y le dices que repare el sistema operativo?...A ver si repara el arranque....

Bueno pues si el colega del AMD esta disponible este finde largo tengo intencion de probar lo siguiente: (que no pare esa musica!!! je,je,je)
Tengo un w2000 en un HD instado desde un P4 que no arranca en el AMD ademas de mi HD tambien instalado el W2000 con P4.
Opcion 1) Con el HD mio metiendolo como esclavo del que si funciona en AMD, el suyo original,
pasarle todo el directorio winnt (ocultos incluidos), si es problema de que le falta algun sys, dll, com o similar digo yo que lo pillara, lo unico que igual actualiza los .ini y la jodo porque luego buscara cosas que no hay, copiare algunos que me se como el regedit y el win.ini.
Opcion 2) Meter el HD nuevo, no el mio, en el AMD y reinstalar W2000 con el AMD, quizas actualice los controladores, dll, sys y demas hostietas que le faltan, no?
Pues os digo algo a medida que vaya viendo,
buen finde!!!