Os funciona el modo a tiempo real de los antivirus cuando el ordenador esta en modo a prueba de fallos?

Concretamente el kapesky o el panda titanium 2006.
Porque a mi no me detectan ningun virus en modo normal. Pero al ponerlos en modo prueba de fallos y arrancar el antivirus me dice que no se puede iniciar el servicio y la causa podria ser un virus.
Pues eso es una encuesta para cuestionar la normalidad de mi situacion.
¿Cuando el ordenador esta en modo prueba de fallos se puede habilitar el antivirus en tiempo real o es normal que no se active?
PD: El interes que tengo es porque elimine recientemente un virus troyano ( el Startpage ) que te canvia la pagina de inicio del explorador y te logea el teclado. Pero con el ordenador en modo normal el troyano va apareciendo y el antivirus lo va eliminando y apareciendo de nuevo. Entre sus capacidades esta la de desabilitar los antivirus y la forma segura de eliminarlo es en modo prueba de fallos. ¿Pero si no se activa el antivirus es seguro el escaneo que haga del sistema?
El panda antivirus directamente se bloquea y no quiere escanear.(a parte de que no se active)
Y el kapersky puede escanear pero no se quiere activar tampoco.
Y ahora estoy confuso y no se si esta eliminado el troyano o no.
